ماریو گوتسه در تابستان 2013 با پرداخت شدن رقم فسخ قرارداد 37 میلیون یورویی‌اش توسط بایرن‌مونیخ به جمع باواریایی‌ها پیوست و به 12 سال حضورش در بورسیا دورتموند پایان داد. او در همان فصل اول حضورش در این تیم، قهرمانی در بوندس‌لیگا و جام حذفی آلمان را تجربه کرد.
مهاجم تیم ملی آلمان که در فینال جام جهانی 2014 گل قهرمانی ژرمن‌ها را مقابل آرژانتین به ثمر رساند، پس از گذشت 18 ماه از حضورش در جمع سرخپوشان مونیخی‌ها در گفت‌و‌گو با شبکه تلویزیونی «ESPN» گفت: به‌طور حتم سال اول حضورم در بایرن‌مونیخ آسان نبود. من در حالی به بایرن‌مونیخ پیوستم که سه‌گانه قهرمانی آلمان و اروپا را از آن خود کرده بود.
وی افزود: من مصدوم بودم و پس از انجام 2 بازی برای بایرن مجدداً برای 3 ماه دیگر مصدوم شدم. در کنار مصدومیتم به مدت 3 یا 4 ماه در هتل زندگی کردم. به همه این مشکلات، سازگاری با شرایط زندگی در بایرن‌مونیخ را که متفاوت‌تر از شرایط زندگی در بورسیا دورتموند بود، اضافه کنید که خود شرایط را برایم خیلی دشوار کرد ولی فکر می‌کنم حالا به خوبی خودم را در اینجا جا انداخته‌ام.
هافبک نفوذی 22 ساله باواریایی‌ها در ادامه عنوان کرد: نمی‌خواهم بگویم که خیلی تغییر کرده‌ام ولی حالا نسبت به 18 ماه گذشته در شرایط بهتری قرار دارم. در ورزش آمادگی جسمانی خیلی مهم است و باید همیشه از این حیث حس خوبی داشته باشید. کارهای زیادی است که قصد دارم انجامش بدهم. همیشه به فکر پیشرفت و بلوغ هر چه بیشتر هستم و پپ گواردیولا همان مربی است که میتوانم زیرنظرش به این اهدافم برسم.
